CIK består af 7 selvstændige idrætsklubber – eller afdelinger – som alle er optaget i Christianshavns Idræts Klub (CIK). 5 af afdelingerne træner i klubhuset Bådsmandsstræde 20. Det kalder vi CIK Sportscenter. CIK Håndbold træner i Hal C og CIK Fodbold træner på Kløvermarken.
CIK Sportscenter huser desuden også en hovedafdeling, der organiserer fælles interesser for afdelingerne. Det er for eksempel lokalt ungdomsarbejde, repræsentation i politiske lokaludvalg og driften af centeret. Centeret huser også Støtteforeningen for CIKs Ungdom, som har til formål at yde støtte til rejser, stævner, kampudstyr eller individuel støtte til børn og unge, så de kan deltage i en afdelings aktiviteter.
CIK er mere end 100 år gammel og gennem tiderne har der være adskillige logoer. Nogle af de gamle bruges stadig af klubberne. De 3 mest brugte ses til venstre. Det ældste logo viser Vor Frelsers Kirkes ikoniske tårn, og det er også valgt som motiv i det nyeste logo, som ses herunder.
